Wykonawca musi ściśle zastosować się do indywidualnego opisu każdej pozycji w otrzymanym przedmiarze - bo rozumiem, że na nich się tu opieramy. Jeśli występuje rozbieżność z innymi danymi (z projektem, ze specyfikacją techniczną,  z wykazem materiałów...) to należy wyjaśnić i ustalić prawdę. Z indywidualnego opisu mogą, a nawet powinny wynikać materiały i inne sprawy; ogólne zapisy oryginalnego KNR nie mają tu znaczenia.
Sprawy narzutów nic nie reguluje, dla każdej pozycji wykonawca ma prawo ustalić jak mu wychodzi. Według starych zasad kosztorysowania narzuty były jednakowe dla całego kosztorysu, ja bym proponował z powodów praktycznych ujednolicić dla jego części. Nie widzę żadnego związku narzutów z KNR.
Nakłady zawarte w tradycyjnych KNR zawsze (?!) traktowało się indywidualne, a zwłaszcza materiały. Ścisłe trzymanie się zapisów tam zawartych na większą skalę NIGDY nie było możliwe (być może dlatego już prawnie nie obowiązują).
Jeśli już opieramy kalkulację o konkretne pozycje KNR, to nie zapominajmy o aktualizacji treści opisu (!) i o uwagach typu ?kalkulacja indywidualna?, ?pozycja zastępcza? - stosownie do potrzeb.
Acha, na koniec ważne: należy przede wszystkim dostosować się do odpowiednich zapisów specyfikacji, wtedy nie ma co bać się odrzucenia (przynajmniej z tego powodu).

Mam nadzieję, że zaspokoiłem ciekawość wyrażoną w zapytaniu, ale jeśli nie do końca, to gotów dalej.