Wyliczająć wartość brutto należy wyjść z kwoty jedn. netto, tak?

Tak może być, tzn. liczyć wszystko na kwotach netto, a podatek  naliczać jednorazowo na samym końcu.
Jednocześnie przepisy dopuszczają postępowanie odwrotne, tzn. pracować na cenach z podatkiem, zaś całkowitą kwotę podatku naliczać na końcu, stosownie do całkowitej ceny.

Nieporozumieniem jest rozliczanie netto, brutto i podatku na każdym poziomie,  niby dokładne (?), jednak mylące. W większości przypadków nie uzyska się zgodności kwot. Chyba, żeby liczyć na liczbach ściśle DOKŁADNYCH, co przy naszych nawykach zaokrągleń jest mało realne.

Specyfikacja jest miejscem, gdzie można o powyższym decydować - w ramach obowiązkowego opisu sposobu ustalania ceny. Tam też należy zacząć poszukiwać odpowiedzi na pytania.