Więc nie jest tak do końca, że realizacja umowy się kończy i kończy się też temat zabezpieczenia. W umowie mamy ustalenie, że 30% zabezpieczenia zostawiamy na na wypadek roszczeń do końca okresu rękojmi.

Dobrze by było załatwić przynajmniej część zostającą na okres rękojmi (to wydaje się bardziej realne i bardziej potrzebne).

hubal jakąż to podstawę prawną znajdujesz w pzp do takiego żądania? moim zdaniem żadnej, ale wskaż proszę błądzącemu drogę podpierając się stosownym artykułem
Zabezpieczenie wykonania dotyczy umowy - zamówienie wykonane, odebrane i zapłacone = koniec umowy. Kwestie rękojmi i gwarancji reguluje już k.c. jak to ładnie wyłuszczył Marcel. Dlaczego chcesz narażać wykonawcę na dodatkowe koszty niezwiązane z pzp?

trzeba było aneks sporządzić w sposób nie tylko zmieniający termin ale również wpisać treść dotyczącą zabezpiecznia

Ja mam jeszcze inny pogląd: PRZED podpisaniem aneksu powinno zostać przedłużone zabezpieczenie, jeśli jest ono w formie niepieniężnej, teraz to ciężko zmusić wykonawcę. Dobrze by było załatwić przynajmniej część zostającą na okres rękojmi (to wydaje się bardziej realne i bardziej potrzebne).