Nawet jeśli nie mam takiego potwierdzenia na piśmie, a jedynie sprawdzając ceny można się zorientować, że ilość stanowisk nie ma znaczenia bo cena jest taka sama?

To w końcu było na piśmie czy nie? Wcześniej było bowiem: ?wykonawcy nie zmienili oferty uzasadniając mi to w piśmie że cena za 1 i za 3 jest taka sama?.

Wszystko musi być na piśmie. Jeśli z oferty i pism wynika, że wykonawca oferuje to, co wymaga zamawiający (po zmianie), to przyjąć ofertę, a ewentualne błędy pisarskie poprawić. Jeśli wynika, że oferuje inny zakres, a cena jest ryczałtowa, to odrzucić. Jeśli cena jest typu kosztorysowego, da się rozliczyć, to raczej poprawić i sprowadzić do wspólnego poziomu.  Jeśli są  wątpliwości co naprawdę zaoferował, to wyjaśniać. To tak schematycznie. Sprawa jest raczej skomplikowana, nie znamy ani specyfikacji, ani korespondencji, ani ofert i nie sposób tu rozstrzygnąć, dalsze dyskusje raczej nie załatwią sprawy. W takiej sytuacji na miejscu sprawę powinien zbadać (zakładowy) prawnik. Skoro już całość zbadał i ocenił, to wykonać jak orzekł.