Skoro spółka złożyła KRS i "coś się w niej przekształca" po śmierci wspólnika - to zakładam, że jest to jakaś osobowa spółka handlowa, najprawdopodobniej spółka jawna. Jeżeli tak - to pomimo zmiany firmy (nazwy) czy też składu wspólników wciąż mamy do czynienia z jednym i tym samym podmiotem (wykonawcą). Zmiany zapewne dotyczą usunięcia nazwiska zmarłego wspólnika z firmy (nazwy)? Firma się zmienia, spółka pozostaje ta sama (czego dowodem jest chociażby ciągle ten sam numer w KRS).

Pozostaje problem rozbieżności w dokumentach. Ja bym wezwał w trybie 26.3 do złożenia _AKTUALNEGO_ odpisu z KRS i wyjaśnienia kwestii innego brzmienia firmy (nazwy) spółki na pozostałych "starych" dokumentach - spółce najłatwiej będzie z tego wybrnąć składając pełny odpis z KRS, tzn. taki, w którym będzie cała historia wpisów, łącznie z "nieaktualnymi" (czyli np. także poprzednie brzmienie firmy).