W kosztorysie ofertowym Wykonawca w jednej pozycji wstawił ilość jednostek inną (większą) niż podana była w przedmiarze robót Zamawiającego.
Czy ta omyłka kwalifikuje się do odrzucenia oferty art.89 ust. 2 pkt.2 ? teść nie odpowiada treści SIWZ?

Wg mnie nie. Raczej wyjaśnienia z art. 87.1 i ewentualnie poprawiasz z 87.2 wraz z konsekwencjami rachunkowymi.
Opcjonalnie u mnie się tak zdarzyło, że Wykonawca, oświadczył, że daną czynność wykona inną technologią niż zakładana w przedmiarze i uznaliśmy to, nie zmieniając jego oferty.